Pada tahun 1969, sebuah institusi pendidikan muncul dengan nama SMT Pertanian Gedongan. Jurusan Pengolahan Hasil Pertanian menjadi andalannya pada saat itu. Tidak lama kemudian, sekitar tahun 1974, Jurusan Mesin Produksi pun bergabung dalam lanskap pendidikan yang diusung. Namun, pada tahun 1977, terjadi perubahan penting dalam manajemen sekolah. Kebijakan baru mengharuskan pemisahan sekolah berdasarkan kelompok mata pelajaran, dan hal ini membawa konsekuensi pembentukan dua entitas pengelola: SMT Pertanian Gedongan, yang tetap fokus pada Rumpun Pertanian dan Perkebunan, serta Jurusan Teknologi Hasil Pertanian. STM Mesin Gedongan, yang melekat pada Rumpun Teknik, dengan Jurusan Mesin Produksi. Tahun 1989 membawa gelombang perubahan lainnya, ketika Menteri Pendidikan mewujudkan transformasi dengan merubah namanya menjadi SMK Muhammadiyah 1 Moyudan. Dalam perubahan ini, bidang Pertanian dan Perkebunan dipertahankan, dan muncul Program Studi Keahlian Teknologi Hasil Pertanian. Tak ketinggalan, SMK Muhammadiyah 3 Moyudan menemukan identitas baru dalam bidang Mesin Produksi, yang membawanya menawarkan Program Studi Keahlian Mekanik Umum. Namun, tahun 2000 membawa dinamika baru dengan perubahan struktur Jurusan: SMK Muhammadiyah 1 Moyudan, tetap berada dalam wadah Pertanian dan Perkebunan, dengan Program Studi Keahlian Teknologi Hasil Pertanian. SMK Muhammadiyah 3 Moyudan, memasuki ranah Otomotif, dengan Program Studi Keahlian Teknik Mekanik Otomotif.
Pada tahun 2003, semangat baru menyelimuti SMK Muhammadiyah 1 Moyudan. Program Studi Keahlian Teknologi Hasil Pertanian berpamitan, memberi jalan bagi lahirnya Program Studi Keahlian Restauran. Tahun 2004, dunia digital juga tak terlupakan, saat Program Studi Keahlian Teknik Komputer dan Jaringan dihadirkan. Namun, 2006 menjadi tahun yang mengubah haluan besar. Persetujuan dari Dinas Pendidikan Pemuda dan Olahraga Kabupaten Sleman membuka pintu bagi penggabungan manajemen sekolah-sekolah dengan fokus pendidikan berbeda. SMK Muhammadiyah 1 Moyudan dan SMK Muhammadiyah 3 Moyudan bersatu, membentuk sebuah entitas baru yang menentukan arah masa depan:
Nama Sekolah: SMK Muhammadiyah 1 Moyudan
Bidang Studi Keahlian:
1) Teknologi
2) Pariwisata dan Kerajinan
3) Komputer dan Komunikasi
Program Studi Keahlian:
1) Teknik Otomotif
2) Restauran
3) Teknik Komputer dan Informatika
Kompetensi Keahlian:
1) Teknik Kendaraan Ringan
2) Restauran
3) Teknik Komputer dan Jaringan.
Perjalanan ini tak berhenti. Pada tahun 2013, semangat inovasi meluas. SMK Muhammadiyah 1 Moyudan menambahkan dimensi baru dalam bentuk Program Studi Keahlian Teknologi dan Rekayasa
Perjalanan ini tak berhenti. Pada tahun 2013, semangat inovasi meluas. SMK Muhammadiyah 1 Moyudan menambahkan dimensi baru dalam bentuk Program Studi Keahlian Teknologi dan Rekayasa
Akhirnya, pada tahun 2017, kesempatan baru muncul. SMK Muhammadiyah 1 Moyudan memperluas sayapnya dalam bidang Pariwisata.
Kisah ini adalah bukti nyata bahwa sekolah bukan hanya tempat memperoleh ilmu, tetapi juga panggung tempat inovasi, perubahan, dan pembentukan masa depan yang cemerlang