Peraturan yang mengatur hal tersebut termuat dalam Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia Nomor 25 tahun 2023 tentang Organisasi dan Tata Kerja Unit Pelaksana Teknis Bidang Laboratorium Kesehatan Masyarakat. BTKLPP Kelas I Makassar ditetapkan menjadi Balai Laboratorium Kesehatan Masyarakat Makassar dan untuk menindaklanjuti peraturan tersebut pada tanggal 1 Januari 2024, BTKLPP Kelas I Makassar bertransformasi menjadi Balai Laboratorium Kesehatan Masyarakat Makassar yang diberi tugas sebagai Labkesmas Tingkat 4 yang berada di regional dengan wilayah kerja meliputi Sulawesi Selatan, Sulawesi Tengah, Sulawesi Barat, dan Sulawesi Tenggara.